Mayojen testamentti on täynnä toimintaa ja lopun aikojen uhkakuvia. Alten punoo mayojen ennustukseen 2000-luvun maailmanpolitiikkaa, muinaista historiaa, myyttejä, tieteellisiä teorioita ja science fictionia.

Michael Gabriel pelasti ihmiskunnan tuhoutumiselta talvipäivänseisauksen aikaan 2012 ja katosi. Mutta kuten 500 vuotta sitten mayojen Popol Vuhissa ennustettiin, Michaelille syntyi kaksi poikaa: vaaleatukkainen, sinisilmäinen Jacob, joka on saanut lahjakseen epäinhimilliset fyysiset kyvyt, huikean älykkyyden ja kyvyn oivaltaa maailmankaikkeutta, sekä tummatukkainen Immanuel, joka torjuu geneettisen kutsumuksensa ja haluaa vain elää normaalia elämää. Ainoastaan yhdistämällä voimansa Gabrielin kaksoset voivat saada isänsä takaisin ja estää ihmiskuntaa toistamasta itsetuhoista käytöstä.

Mutta sinä kohtalokkaana päivänä kun kaksoset syntyvät, syntyy myös kaunis ja skitsofreeninen Lilith. Hänen kutsumuksensa on synkempi ja se johdattelee häntä kohti mayojen helvettiä Xibalbaa - ja kohti mahtavaa taistelua hyvän ja pahan välillä.