Det är något skumt som väcker syskonen Matilda och Emil varje natt. Underliga ljud hörs från lägenheten ovanför. När Matilda och Emil till slut bestämmer sig för att undersöka vad som orsakar ljuden träffar de den nyinflyttade gamle mannen Josef, och efter det blir ingenting som förut.

Det visar sig att Josef har en dörr som leder till Skuggvärlden, en parallellvärld till vår värld, där det råder fullt kaos ända sedan den ondskefulle Skuggmästaren tog över makten och släppte ut alla monster från underjorden. Dessutom försöker Skuggmästaren ta över vår värld. Mitt i smeten hamnar Matilda och Emil som tvingas bege sig till den obehagliga Skuggvärlden för att förhindra att Skuggmästarens lyckas med sin plan. Men hur ska Matilda och Emil kunna stoppa Skuggmästaren och alla tusentals monster i hans följe?